Densha Otoko, littéralement "l'homme du train", narre l'histoire d'un otaku d'une vingtaine d'années, véritable raté, qui sauve une belle jeune fille, Hermés, lorsque celle-ci se fait agresser par un ivrogne, et détaille leurs rendez-vous successifs ainsi que ses appels à l'aide sur un forum de discussion pour célibataires (dans la série, ce forum semi-fictif est appelé "Aladdin Channel").
En dehors de cet aspect "informatique", l'histoire fait également la part belle aux meilleurs côtés des otaku : ils sont coopératifs, compétitifs, gentils et honnêtes. De plus, le style d'Hermès correspond au fantasme de la plupart des otaku. Cette histoire fait intervenir beaucoup de monde venant d'internet, il n'y a pas d'auteur unique. Elle démontre toutes les craintes et l'anxiété des otaku, mais également leur c½ur pur. En ce sens, Densha Otoko est un parfait exemple de cette jeune génération.